研究染色质环挤出在抗体转型中的作用—小柯机器人—科学网 downs

财经频道 2020-01-1774未知admin

  近日,美国儿童医院Frederick W. Alt及其小组染色质环挤出在抗体转型中的基本作用。10月30日,国际知名学术期刊《自然》在线发表了这一。

  研究人员介绍,B淋巴细胞中的抗体转型重组(CSR)用位于下游100-200 kb的六个恒定区外显子(CH)之一取代了免疫球蛋白重链基因座(Igh)C CH。每个CH的上游侧都有一个I型启动子和一个长重复转换(S)区域。downstream细胞因子和激活蛋白引起的激活胞苷脱氨酶(AID)和I型启动子,其中3IgH调节区(3IgHRR)增强子通过I型启动子竞争长距离3IgHRR相互作用控制后者。通过供体S和激活的下游受体S区进行,downstream可将AID产生的脱氨损害靶向于数百个单独的S区域脱氨模体中的任何一个。一般的DNA修复途径将这些损害转变为双链断裂(DSB),并将S上游DSB末端连接到受体S区域下游DSB末端,以删除CSR。分布于活化S区的AID启动的DSB靶点通常参与这种CSR缺失连接。

  研究人员报道染色质环挤出是顺式IgH组织促进缺失CSR的机制的基础。在初始B细胞中,环挤出动态地将3IgHRR增强子与200 kb上游S并列,downstream以生成CSR中心(CSRC)。在CSR激活的原代B细胞中,I型启动子激活cohesin加载,导致生成动态亚结构域,其将下游S区域与S定向对齐以删除CSR。在CH12F3 B淋巴瘤细胞的组成型SCSR期间,可以通过在挤出径中插入基于CTCF结合元件(CBE)的障碍来激活反向CSR。CBE插入还通过和促进CSSR中与S的动态比对,使上游S区CSR失活,并将相邻的下游序列为异位S区。

  这些发现表明,在CSSR中,动态阻碍cohesin介导的环挤出将AID起始的供体和受体S区DSB的正确末端并列,以进行缺失CSR。这种机制可能也有助于致病性DSB加入全基因组。

  Nature:《自然》,创刊于1869年。隶属于施普林格自然出版集团,最新IF:43.07

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